刘祖国教授是《中华眼科杂志》，《中华细胞与干细胞移植》及《中华眼科与视觉科学杂志》等4家杂志副主编，《Ocular Surface》，《中华眼科杂志》等14家国内外杂志编委、 IOVS、Cornea等12家环球眼科杂志审稿人。

刘祖国教授获得了国家杰出青年基金、国家自然科学基金(4项)、863计划项目、973计划项目，NSFC-RGC合作项目等50余项科研基金的资助。共发表文章326篇，其中研究论文266篇，SCI论文98篇。在环球眼科研究杂志IOVS发表研究论文20篇，在环球眼科临床研究杂志ophthalmology发表研究论文6篇。在《中华眼科杂志》发表论文54篇。

刘祖国教授主编及参与编写教材和专著共39部，包括《眼表疾病学》，《角膜地形图学》;2次为人民卫生出版社出版的眼科 专著《中华眼科学》的结膜，角膜和巩膜疾病的分卷主编;2次主编了人民卫生出版社出版的国家5年制本科规范教材《眼科学基础》;是国家5年制本科规范教材《眼科学》的副主编。

刘祖国教授3次获得国家科技进步二等奖，6次获得省部 科技进步一等奖。